Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms