Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms