Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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