Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stambpl1Q76N33 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms