Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rph3alQ768S4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rph3alQ768S4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rph3alQ768S4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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