Protein–RNA interactions for Protein: Q75NR7

Recql4, ATP-dependent DNA helicase Q4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Recql4Q75NR7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Recql4Q75NR7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Recql4Q75NR7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms