Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms