Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms