Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms