Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms