Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms