Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms