Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cachd1Q6PDJ1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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