Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvoplQ6PDF3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SvoplQ6PDF3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms