Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RgmaQ6PCX7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms