Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herc4Q6PAV2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms