Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig3Q6P1C6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms