Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23ipQ6NZC7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms