Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms