Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms