Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q66JV7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q66JV7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q66JV7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q66JV7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q66JV7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q66JV7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q66JV7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms