Protein–RNA interactions for Protein: Q64163

Tfdp2, Transcription factor Dp-2, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp2Q64163 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tfdp2Q64163 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfdp2Q64163 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms