Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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