Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vil1Q62468 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms