Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms