Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms