Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms