Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ss18Q62280 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ss18Q62280 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ss18Q62280 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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