Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms