Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttf1Q62187 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttf1Q62187 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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