Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbm38Q62176 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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