Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sin3bQ62141 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms