Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lama3Q61789 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lama3Q61789 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Lama3Q61789 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Lama3Q61789 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Lama3Q61789 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms