Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms