Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms