Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcd2Q61285 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms