Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms