Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms