Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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