Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NinQ61043 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NinQ61043 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NinQ61043 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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NinQ61043 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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NinQ61043 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NinQ61043 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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NinQ61043 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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NinQ61043 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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NinQ61043 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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NinQ61043 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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NinQ61043 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NinQ61043 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NinQ61043 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NinQ61043 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NinQ61043 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms