Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot7Q60809 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms