Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcf4Q60722 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms