Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms