Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms