Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tsr1Q5SWD9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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