Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms