Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PkdccQ5RJI4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PkdccQ5RJI4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms