Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms