Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp28Q5I043 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp28Q5I043 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp28Q5I043 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp28Q5I043 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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