Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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